Правовые акты органов государственных доходов с момента назначения и по результатам проведения налоговой проверки могут быть обжалованы в судебном порядке.

К таким актам относятся: предписание, акт документальной налоговой проверки, уведомление о результатах проверки.  

Предписание в качестве акта о назначении проверки может быть самостоятельным предметом судебного оспаривания. При этом налогоплательщикам следует иметь в виду, что не допускается принятие судами мер по обеспечению иска в виде приостановления действия оспариваемого предписания. Таким образом, обжалование предписания не приостанавливает проведение самой проверки.     

Более того налогоплательщикам следует знать, что предписание органа государственных доходов может быть оспорено только до прекращения его действия, а значит до завершения налоговой проверки путем составления акта налоговой проверки.

В свою очередь акт налоговой проверки может быть обжалован, если налогоплательщик не согласен с его выводами, не повлекшими начисление налогов и других обязательных платежей в бюджет, однако влияющими на его права и обязанности, в том числе и в будущих налоговых периодах.

Завершением налоговой проверки является вынесенное органом государственных доходов уведомление о результатах налоговой проверки.

В случае несогласия налогоплательщика с начисленными суммами налогов и платежей в бюджет, обязательств по исчислению, удержанию, перечислению обязательных пенсионных взносов, исчислением и уплатой социальных отчислений и (или) взносов на обязательное социальное медицинское страхование и пеней, уменьшением убытков, неподтверждением к возврату сумм превышения НДС, обжалованию в судебном порядке подлежит только уведомление.

Дела об обжаловании перечисленных актов органов государственных доходов подсудны специализированным межрайонным экономическим судам.

Срок обращения с заявлением в суд составляет три месяца со дня, когда налогоплательщику стало известно о нарушении прав, свобод и законных интересов.

Указанный срок исчисляется: в случае оспаривания уведомления о результатах налоговой проверки непосредственно в суде - со дня его вручения, а в случае предварительного обжалования в уполномоченный орган – Министерство финансов со дня, когда налогоплательщику стало известно о решении этого органа.

Если по результатам рассмотрения жалобы налогоплательщика уполномоченным органом вынесено новое уведомление, срок его обжалования исчисляется заново со дня его вручения.

При обжаловании действий (бездействия) должностных лиц органов государственных доходов указанный срок исчисляется со дня, когда налогоплательщику, стало известно о нарушении его прав и охраняемых законом интересов либо об оставлении вышестоящим органом государственных доходов его жалобы без удовлетворения полностью или в части.