При выявлении нарушений налогового законодательства органы государственных доходов в порядке, установленном статьей 96 Кодекса Республики Казахстан «О налогах и других обязательных платежах в бюджет» (Налоговый кодекс), направляют в адрес налогоплательщика уведомление об устранении нарушений, выявленных органами государственных доходов по результатам камерального контроля с приложением описания выявленных нарушений.

Составной частью системы управления рисками является - камеральный контроль.

Камеральный контроль - контроль, осуществляемый налоговыми органами на основе изучения и анализа представленной налогоплательщиком (налоговым агентом) налоговой отчетности, сведений уполномоченных государственных органов, а также других документов и сведений о деятельности налогоплательщика.

Цель камерального контроля - предоставление налогоплательщику права самостоятельного устранения нарушений, выявленных налоговыми органами по результатам камерального контроля, путем постановки на регистрационный учет в налоговых органах и (или) представления налоговой отчетности в соответствии со статьей 96 Налогового  кодекса и (или) уплаты налогов и платежей в бюджет.

Камеральный контроль проводится путем сопоставления следующих данных, имеющихся в налоговых органах:

1) налоговой отчетности;

2) сведений иных государственных органов об объектах налогообложения и (или) объектах, связанных с налогообложением;

3) сведений, полученных из различных источников информации, по деятельности налогоплательщика;

4) иной отчетности, установленной Налоговым кодексом.

Камеральный контроль проводится после выписки счетов-фактур в электронной форме и (или) за соответствующий налоговый период после истечения срока представления налоговой отчетности за такой период, установленного Налоговым кодексом.

Камеральный контроль осуществляется в течение срока исковой давности с учетом положений, установленных статьей 48 Налогового кодекса.

По результатам камерального контроля оформляются:

- по нарушениям с высокой степенью риска - уведомление об устранении нарушений, выявленных налоговыми органами по результатам камерального контроля, с приложением описания выявленных нарушений и их степени риска;

- по нарушениям со средней степенью риска - уведомление об устранении нарушений, выявленных налоговыми органами по результатам камерального контроля, с приложением описания выявленных нарушений и их степени риска;

- по нарушениям с низкой степенью риска - извещение о нарушениях, выявленных по результатам камерального контроля, с приложением описания выявленных нарушений и их степени риска.

Исполнение уведомления об устранении нарушений, выявленных налоговыми органами по результатам камерального контроля, осуществляется налогоплательщиком (налоговым агентом) в течение 30 рабочих дней со дня, следующего за днем его вручения (получения).

Согласно пункта 2 статьи 96 Налогового кодекса исполнением уведомления об устранении нарушений, выявленных налоговыми органами по результатам камерального контроля, признается представление налогоплательщиком (налоговым агентом) одного из следующих документов:

- в случае согласия с выявленными нарушениями представления налоговой отчетности по уведомлению за налоговый период, к которому относятся выявленные нарушения;

- в случае несогласия с указанными в уведомлении нарушениями со средней степенью риска - представление в налоговый орган, пояснения об отсутствии нарушений с приложением выписок из регистров налогового и (или) бухгалтерского учетов (учета) и (или) документов, относящихся к указанным нарушениям, подтверждающих достоверность данных, внесенных в налоговую отчетность, за исключением случаев, предусмотренных пунктом 3 статьи 96 Налогового кодекса;

- жалобы на действия (бездействие) должностных лиц налоговых органов по направлению такого уведомления.

 При камеральном контроле декларации по индивидуальному подоходному налогу и социальному налогу, часто выявляются следующие нарушения:

- по не отражению налоговым агентом (юридическое лицо, индивидуальный предприниматель) наемных работников в Формах налоговой отчетности (далее ФНО) 200.00 при наличии оборотов по ФНО, а также других признаков осуществления предпринимательской деятельности на основании иных источников информации;

- по данным налоговой отчетности получены доходы от предпринимательской деятельности, либо на основании иных источников данных предполагается наличие работников, однако налоговым агентом не задекларированы начисленные доходы работников, в связи с чем возникает вероятность занижения индивидуального подоходного налога, социального налога, а также социальных платежей (социальные отчисления, обязательные пенсионные взносы, обязательное социальное медицинское страхование).

При подтверждении нарушения: налогоплательщик предоставляет дополнительную форму налоговой отчетности 200.00 за период нарушения. В 200.00 форме отражает численность работников. В строке 200.00.001 отражают сумму индивидуального подоходного налога (ИПН) исчисленного с доходов работника, а также суммы социальных платежей в соответствующих строках. Также заполняет приложение № 5 к декларации форма 200.05 с указанием работников.

При не подтверждении нарушения: налогоплательщик предоставляет подтверждающие документы. А именно, заявление и приказ об увольнении или приказ о нахождении в отпуске без содержания.

Следует отметит, что руководитель Товарищества с ограниченной ответственностью, независимо от того, является он наемным сотрудником или сам владеет компанией, с точки зрения трудового законодательства считается работником этой организации. В статье 140 Трудового кодекса РК подробно расписано, как регулируется деятельность руководителя юридического лица. Трудовой договор не заключается, но «трудовые отношения оформляются актом работодателя о приеме на работу, который должен содержать трудовую функцию, срок осуществления трудовой деятельности, дату начала работы, место выполнения работы, а также размер и иные условия оплаты труда».

В статье 104 Трудового кодекса указано, что размер заработной платы не может быть меньше минимальной заработной платы, установленной на соответствующий финансовый год. Поэтому, начислять зарплату руководителю нужно в любом случае, даже когда нет денег на выплату зарплаты, либо приостановили деятельность или только открылись и ещё не начали работать.

Неисполнение в установленный срок уведомления об устранении нарушений, выявленных налоговыми органами по результатам камерального контроля, влечет приостановление расходных операций по банковским счетам налогоплательщика в соответствии со статьей 118 Налогового кодекса.

Невыполнение налогоплательщиком законных требований органов государственных доходов и их должностных лиц влечет административную ответственность согласно статье 288 Кодекса РК «Об административных нарушениях».